Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MMP3P08254 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MMP3P08254 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MMP3P08254 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MMP3P08254 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP3P08254 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP3P08254 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP3P08254 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP3P08254 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP3P08254 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MMP3P08254 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms