Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MSMBP08118 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MSMBP08118 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MSMBP08118 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MSMBP08118 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MSMBP08118 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MSMBP08118 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MSMBP08118 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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MSMBP08118 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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MSMBP08118 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MSMBP08118 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MSMBP08118 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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