Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPBP07199 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPBP07199 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPBP07199 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms