Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-HP01893 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-HP01893 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms