Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGFRP00533 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGFRP00533 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EGFRP00533 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EGFRP00533 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EGFRP00533 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EGFRP00533 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EGFRP00533 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGFRP00533 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFRP00533 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFRP00533 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFRP00533 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFRP00533 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFRP00533 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFRP00533 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFRP00533 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGFRP00533 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms