Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR1AO95602 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR1AO95602 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms