Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SBF1O95248 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SBF1O95248 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SBF1O95248 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SBF1O95248 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SBF1O95248 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SBF1O95248 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBF1O95248 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBF1O95248 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBF1O95248 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBF1O95248 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBF1O95248 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBF1O95248 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBF1O95248 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBF1O95248 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SBF1O95248 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms