Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP19O94966 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP19O94966 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP19O94966 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP19O94966 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP19O94966 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP19O94966 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP19O94966 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP19O94966 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP19O94966 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP19O94966 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USP19O94966 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP19O94966 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP19O94966 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP19O94966 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP19O94966 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP19O94966 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP19O94966 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP19O94966 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP19O94966 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP19O94966 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP19O94966 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP19O94966 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP19O94966 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP19O94966 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP19O94966 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP19O94966 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP19O94966 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP19O94966 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP19O94966 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP19O94966 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP19O94966 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP19O94966 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP19O94966 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP19O94966 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP19O94966 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP19O94966 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP19O94966 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP19O94966 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP19O94966 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP19O94966 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP19O94966 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP19O94966 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP19O94966 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP19O94966 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP19O94966 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP19O94966 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP19O94966 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP19O94966 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms