Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms