Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX3O75364 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX3O75364 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX3O75364 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX3O75364 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX3O75364 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms