Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms