Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSPNO60542 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSPNO60542 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSPNO60542 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPNO60542 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPNO60542 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSPNO60542 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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