Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY75O60449 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY75O60449 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY75O60449 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LY75O60449 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LY75O60449 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LY75O60449 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY75O60449 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY75O60449 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY75O60449 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY75O60449 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY75O60449 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY75O60449 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY75O60449 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY75O60449 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY75O60449 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY75O60449 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY75O60449 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY75O60449 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY75O60449 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LY75O60449 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms