Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KIAA0556O60303 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KIAA0556O60303 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms