Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VEGFDO43915 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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VEGFDO43915 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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VEGFDO43915 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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VEGFDO43915 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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VEGFDO43915 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VEGFDO43915 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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