Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRY3O43610 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms