Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA2O43364 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms