Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM2O43147 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGSM2O43147 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms