Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIP1O00291 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIP1O00291 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIP1O00291 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIP1O00291 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms