Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP23O00161 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP23O00161 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms