Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC01387J3KSC0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms