Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H7C1D1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H7C1D1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H7C1D1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H7C1D1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C1D1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C1D1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms