Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms