Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KRBOX1C9JBD0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms