Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF316A6NFI3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF316A6NFI3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms