Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNOT1A5YKK6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNOT1A5YKK6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms