Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPDC1A2A3K4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPDC1A2A3K4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms