Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FRMD3A2A2Y4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms