Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRERF1Q96PN7 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRERF1Q96PN7 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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