Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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