Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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RTN1Q16799 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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RTN1Q16799 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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RTN1Q16799 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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RTN1Q16799 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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RTN1Q16799 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RTN1Q16799 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RTN1Q16799 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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