Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
E2F4Q16254 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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