Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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PTPROQ16827 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPROQ16827 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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