Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CCDC6Q16204 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms