Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
MKRN3Q13064 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
MKRN3Q13064 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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