Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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PCSK7Q16549 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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PCSK7Q16549 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PCSK7Q16549 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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PCSK7Q16549 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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PCSK7Q16549 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PCSK7Q16549 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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