Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
BNIP3Q12983 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
BNIP3Q12983 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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