Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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FOXD1Q16676 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
FOXD1Q16676 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
FOXD1Q16676 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
FOXD1Q16676 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
FOXD1Q16676 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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FOXD1Q16676 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
FOXD1Q16676 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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FOXD1Q16676 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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FOXD1Q16676 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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FOXD1Q16676 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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FOXD1Q16676 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
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FOXD1Q16676 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
FOXD1Q16676 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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FOXD1Q16676 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
FOXD1Q16676 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
FOXD1Q16676 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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