Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
HIF1AQ16665 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HIF1AQ16665 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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