Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TTF1Q15361 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms