Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 DNAH9-201ENST00000262442 13750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PARP14-202ENST00000474629 7915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRTAP21-2Q3LI59 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms