Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PCOLCEQ15113 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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