Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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