Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL4BQ13620 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL4BQ13620 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL4BQ13620 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL4BQ13620 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL4BQ13620 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL4BQ13620 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL4BQ13620 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL4BQ13620 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CUL4BQ13620 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CUL4BQ13620 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms