Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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LHX3Q9UBR4 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX3Q9UBR4 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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