Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SPG7Q9UQ90 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms