Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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ERCC8Q13216 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ERCC8Q13216 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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