Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U3KQE9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U3KQE9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U3KQE9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
U3KQE9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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