Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00312Q9Y6C7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms