Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDP1Q9Y5B0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms